مورینیو علاقه مند است که هدایت تیم بایرن مونیخ را برعهده بگیرد.پس از اینکه بایرن مونیخ در حساس ترین بازی خود در بوندسلیگا با نتیجه 3_0 از لورکوزن شکست خورد،هواداران این تیم به ادامه همکاری با توماس توخل بد بین شدند.یان کریستین دریسن مدیر اجرایی باشگاه بایرن مونیخ پس از بازی شب گذشته در گفتوگو با شبکه تلویزیونی «اسکای اسپورت» تأکید کرد که جایگاه توخل در این تیم در خطر نیست و موضع باشگاه بر حمایت از او و کادرفنیاش تغییر نکرده است.
مورینیو علاقه مند است که در بایرن مونیخ هم مربیگری کند.
کریستین فالک خبرنگار سرشناس آلمانی که با نشریه «بیلد» همکاری میکند، مدعی شده که ژوزه مورینیو سرمربی پیشین تیمهای رُم، اینتر، چلسی، رئال مادرید و منچستریونایتد به دنبال مربیگری بایرن مونیخ است. این روزنامهنگار مدعی شده که شنیده است آقای خاص در حال یادگیری زبان آلمانی بوده و در گذشته هم نسبت به مربیگری بایرن علاقه نشان داده است.